Øvelse 1

Der er foretaget målinger på niveauet for en kræftcelles genekspression for genet c-Myc. Følgende måleresultater blev opnået:

Genekspression for c-Myc:

Kræftcelle

114,6

112,9

98,5

106,7

109,8

103,6

1. Beregn gennemsnittet for måleserien (svar = 107,6833)
2. Beregn standardafvigelsen for måleserien (svar = 6,0251)
3. Hvad er antallet af frihedsgrader for måleserien?
4. Vurder vha. t-test for ét gennemsnit hvorvidt det med 95 % sikkerhed kan konkluderes, at det gennemsnitlige niveau for kræftcellens ekspression af c-Myc er højere end 100 (svar = ja, idet t = 3,1236 > 2,0151)
5. Kan dette også konkluderes med 99 % sikkerhed (svar = nej, idet t < 3,3649)
6. Lav et 95 % konfidensinterval for det gennemsnitlige niveau for kræftcellens ekspression af c-Myc (svar = [101,3604 ; 114,0063])

Øvelse 2

For genet DCC blev en rask celles cDNA mærket med grøn og en kræftcelles med rød. Begge celletypers cDNA blandes sammen, og der foretages målinger af flourescens. Målingen vil være negativ, hvis der er mest rød farve (svarende til at kræftcellen har højere genekspression), mens den vil være positiv, hvis der er mest grøn farve (svarende til at den raske celle har højere genekspression).  Følgende måleresultater for ekspressionen af DCC blev opnået:

Genekspression for DCC:

Flourescens
2,0
-0,12
-0,5
1,5
0,98
0,647
0,21
0,12
-0,42
-0,32
3,1

1. Beregn gennemsnittet for måleserien (svar = 0,6543)
2. Beregn standardafvigelsen for måleserien (svar = 1,1459)
3. Hvad er antallet af frihedsgrader for måleserien?
4. Vurder vha. t-test hvorvidt det med 95 % sikkerhed kan konkluderes, at det gennemsnitlige niveau for måleserien er over 0 (svar = ja, idet t = 1,8936 > 1,8125)
5. Hvad svarer nulhypotesen til?
6. Lav et 90 % konfidensinterval for det gennemsnitlige flourescens-niveau (svar = [0,0280 ; 1,2805])

Øvelse 3

For genet p53 blev der foretaget målinger af genekspression for en rask celle og en kræftcelle. Følgende måledata blev opnået:

Genekspression for p53:

Rask celle	Kræftcelle
100	33,2
97,5	45
101,2	12,2
87,4	10,1
120	34,9
114	27,8
99,9	46,2
92,5	30,6
88,6	5,9
102,3	10,6
104	17,8

1. Beregn gennemsnittet for måleserierne (svar X1 = 100,6727, X2 = 24,9363)
2. Beregn standardafvigelsen for måleserien (svar S1 = 9,8233, S2 = 14,3656)
3. Beregn den poolede standardafvigelse (svar Sp = 12,3059)
4. Hvad er antallet af frihedsgrader for måleserien (v = 20)?
5. Vurder vha. t-test for to gennemsnit hvorvidt det med 95 % sikkerhed kan konkluderes, at det gennemsnitlige niveau for den raske celles ekspression af p53 er højere end kræftcellens (svar = ja, idet t = 2,6243 > 1,7247)
6. Hvad kan der på baggrund af ovenstående resultat konkluderes angående genet p53?
7. Lav et 95 % konfidensinterval for forskellen på de to celletypers genekspressions-niveauer (svar = [64,7908 ; 86,6819])

Øvelse 4

For genet K-Ras blev der foretaget målinger af genekspression for en rask celle og en kræftcelle. Følgende måledata blev opnået:

Genekspression for K-Ras:

1. Beregn gennemsnittet for måleserierne (svar X1 = 97,8727, X2 = 961,3091)
2. Beregn standardafvigelsen for måleserien (svar S1 = 10,4022, S2 = 78,4159)
3. Beregn den poolede standardafvigelse (svar Sp = 55,9342)
4. Hvad er antallet af frihedsgrader for måleserien (v = 20)?
5. Vurder vha. t-test hvorvidt det med 95 % sikkerhed kan konkluderes, at det gennemsnitlige niveau for den raske celles ekspression af K-Ras er lavere end kræftcellens (svar = ja, idet t = -6,5822 < -1,7247)
6. Kan dette også konkluderes med 99 % sikkerhed (svar = ja, idet t = -6,5822 < -2,5280)
7. Hvad kan der på baggrund af ovenstående resultat konkluderes angående genet K-Ras?
8. Lav et 95 % konfidensinterval for forskellen på de to celletypers genekspressions-niveauer (svar = [813,6853 ; 913,1874])