Ordforklaring

En anden betegnelse for en matematisk model med ligninger/formler, der sammen danner et flow og dermed kan løse et givent problem.

Sammenligning af DNA- eller proteinsekvenser. Man kan lave et enkelt alignment, hvor man sammenligner to sekvenser eller et multiple alignment, hvor man sammenligner tre eller flere sekvenser.

Programmeret celledød eller "celle selvmord". Cellen nedbrydes ved påvirkning af signalmolekyler (eller mangel på samme),.der bliver aktiveret ved eksempelvis stress.

Forkortelse for Basic Local Alignment Search Tool, som er en metode, hvorpå man kan sammenligne en DNA- eller proteinsekvens på tværs af databaser med kendte sekvenser.

Forkortelse for coding sequence og er den del på DNA-sekvensen der koder for selve proteinet.

Tre nukleotider, der oversættes til en aminosyre af ribosomerne. Der findes 4 nukleotider, hvilket er ensbetydende med, at der findes 64 (4³) mulige forskellige codons.

Betegnelse for processen: DNA  → mRNA  → protein. Processen fra DNA til mRNA betegnes transkription, og processen fra mRNA til protein betegnes translation.

En eller flere dele af en DNA-sekvens, der IKKE er en del af den kodende sekvens, CDS, dvs. det er dele af en DNA-sekvens, der IKKE indgår i det mRNA, der translateres til protein.  

Læren om organismers slægtskab.

Et slægtskabsstæ, hvor man kan visualisere organismernes evolutionære slægtskab.

Genbank er hoveddatabasen for kendte DNA-sekvenser og kan findes gennem NCBI's internetside. 

Hver kendt DNA-sekvens i Genbank har en tilhørende genbank side, hvor informationer om DNA-sekvensen kan findes. 

En fordanskning af det engelske ord clade, der er en fælles betegnelse for alle de organismer (taxa), der har samme stamfader.

En eller flere dele af en DNA-sekvens, der indgår i den kodende sekvens, CDS. Introns bliver sat sammen, så de danner det færdige mRNA, der bliver translateret til protein.  

I forbindelse med proteinstruktur er dette den færdige form af proteinet, og består af forskellige subunits, der alle er i deres tertiære form.  

Der findes i alt tre forskellige læserammer på hver DNA-streng (i alt seks, hvis man medtager begge DNA-strenge). Da tre nukleotider (en codon) koder for en aminosyre, kan man aflæse en DNA-/RNA-sekvens på tre forskellige måder, da aflæsningen kan starte på tre forskellige positioner, der vil give tre forskellige aminosyresekvenser.

Forkortelse for National Center for Biotechnology Information, som er den mest omfangsrige database med biologisk relateret materiale. Den indeholder blandt andet DNA- og proteinsekvenser, forskningsartikler og bioinformatiske værktøjer så som BLAST.

Betegnelsen for den sekvens man laver en BLAST søgning med.

Den måde hvorpå et protein er foldet på (α-helix eller β-plader), og henviser således til proteinstruktur.

Den varierende del på en aminosyre, og dermed den del af molekylet, der gør det specifikt og giver det dets karakteristiske egenskaber.

Den knob (taxon) på et fylogenetisk træ, hvorfra to nye taxa udvikler sig. Den "ældre" taxon er dermed stamfader for de to nye.

Specificerer hvor på mRNA-molekylet translationen af mRNA til protein skal starte. Startcodonen er i de fleste tilfælde nukleotid-tripletten ATG.

Specificerer hvor translationen af mRNA til protein skal stoppe på mRNA-molekylet. Stopcodonen er en af nukleotid-tripletterne UAA, UGA eller UAG.

I fylogeni betegner dette to taxa, der begge har samme stamfader.

Betegnelse for en spids på et fylogenetisk træ, der repræsenterer en organisme. Flere taxons betegnes taxa.

Den proces, den del af det centrale dogme, hvor DNA bliver oversat til mRNA.

Et protein der binder til DNA og påvirker transkriptionen af det. Transkriptionsfaktorer kan opregulere (aktivere)  transkriptionen af DNA'et eller de kan mindske transkriptionen (inhibere) af DNA’et.

Den proces, den del af det centrale dogme, hvor mRNA aflæses til aminosyrer og dermed oversættes til protein.

Betegner den taxon, som er mindst belægtet med alle de andre taxa i det slægtskab, man undersøger. På engelsk kaldes det en outgroup.

Betegnelsen for en proteinfoldning hvor fire aminosyrer interagerer med en zink ion for at give stabilitet til proteinets tertiære struktur (dets foldning).