Immunologisk bioinformatik
Eleverne vil i dette projekt stifte bekendskab med de forskellige bioinformatiske redskaber der er offentlige tilgængelige. Projektet er konstrueret som et portefølje med 4 hovedøvelser der hver tager udgangspunkt i ét bestemt protein. De 4 hoved øvelser er selv inddelt i 3-4 del-øvelser der hver arbejder med netop et program.
Hovedøvelserne kan bruges som et mini-projekt løbende over 1-2 moduler, men hver del-øvelse kan også laves for sig selv og dermed bruges direkte i undervisningen som eksempler.
| Beskrivelse af samt guide til: |
|
Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) |
| |
|
FigTree |
| |
|
National Center for Biotechnology Information (NCBI) |
| |
|
Protein Databank (PDB) |
| |
|
PyMol |
| |
|
UniProt |
| |
|
Virtual Ribosome |
Gå til elevmaterialet, guiderne.
| Teoridele indeholdende: |
|
Codon og læserammer |
| |
|
Fylogeni |
| |
|
Proteinstruktur |
| |
|
Sekvenssammenligning |
Gå til elevmaterialet, teorien.
| Biologisk relevante øvelser med: |
|
Aktin og Myosin |
| |
|
Myostatin og follistatin |
| |
|
Antistoffer |
| |
|
Kræftmolekylet P53 og Green Flourescent Protein |
Gå til øvelserne.
Hver af øvelserne har et svar ark tilknyttet så øvelserne er nemme at implementere i undervisningen.
Svararkene er kun tilgængelige for lærer, og kan kan findes gennem lærerindgangen.